بررسی عفونت ریوی مایکوپلاسمایی ناشی از مایکوپلاسما مایکوئیدس واریته مایکوئیدس و مایکوپلاسما کاپری کولوم واریته کاپری کولوم در گوسالهها و بزهای کشتارشده به روش PCR
فهرست
عنوان …………………………………………………..
الف- مقدمه………………………………………. ۱
ب-چکیده…………………………………………. ۳
فصل اول:کلیات …………………………………… ۵
۱- تاریخچه …………………………………… ۶
۲- خصوصیات کلی مایکوپلاسما…………………………. ۶
۳- مقاومت مایکوپلاسماها…………………………… ۸
۴- طبقه بندی مایکوپلاسماها………………………… ۹
۵- طبقه بندی کلاستر مایکوئیدس……………………… ۱۲
۶- فیلوژنی……………………………………… . ۱۴
۷- ساختمان ……………………………………. ۱۵
۱-۷-ساختمان مایکوپلاسما مایکوئیدس …………………… ۱۵
۲-۷- ساختمان مایکوپلاسما کاپری کولوم ………………. ۱۷
۸- بیولوژی مولکولی………………………………. ۱۹
۹- توالیهای تکراری………………………………. ۲۳
۱۰- پروتئینهای سطحی……………………………… ۲۵
۱۱- فاکتور حدت………………………………….. ۳۰
۱۲- آنالیز پروتئین …………………………….. ۳۲
۱۳- طبقه بندی سویهها ……………………………. ۳۴
۱۴- مشخصات گونه مایکوئیدس………………………… ۳۵
۱۵- کشت و رشد گونه مایکوئیدس …………………….. ۳۸
۱۶- کشت و رشد گونه کاپری کولوم …………………… ۴۱
۱-۱۶- محیط Thiacourt ……………………………… 41
۱۷- بیماری پلوروپنومونی واگیر گاوان……………….. ۴۴
۱-۱۷- علائم بالینی ……………………………….. ۴۵
۲-۱۷- علائم کالبدگشایی بیماری ……………………… ۴۷
۳-۱۷- پاتوژنز …………………………………… ۵۰
۱-۳-۱۷- مکانیسمهای مقابله با دستگاه ایمنی…………… ۵۳
۴-۱۷- اختصاصیت میزبان…………………………….. ۵۷
۵-۱۷- انتقال بیماری …………………………….. ۵۸
۶-۱۷- سیر همه گیری ………………………………. ۵۹
۱-۶-۱۷- مخزن…………………………………….. ۵۹
۲-۶-۱۷- راه انتقال……………………………….. ۵۹
۷-۱۷- پیشگیری و کنترل…………………………….. ۶۰
۱-۷-۱۷- اقدامات لازم برای حفاظت مناطق عاری از بیماری….. ۶۱
۲-۷-۱۷- اقدامات لازم هنگام شیوع بیماری………………. ۶۲
۳-۷-۱۷- اقدامات لازم در مناطق آلوده بومی…………….. ۶۳
۱۸- بیماری پلوروپنومونی واگیر بزان ……………….. ۶۳
۱-۱۸- علائم بالینی ……………………………….. ۶۴
۲-۱۸- علائم کالبد گشایی……………………………. ۶۶
۱۹- گونه مایکوپلاسما کاپریکولوم کاپریکولوم………….. ۶۹
۱-۱۹- سندروم MASKePs…………………………….. 70
۲-۱۹- علائم بالینی………………………………… ۷۱
۳-۱۹- علائم کالبد گشایی……………………………. ۷۱
۴-۱۹- سندروم آگالاکتیه واگیر……………………….. ۷۳
۲۰- گونه مایکوپلاسما کاپری ……………………….. ۷۳
۱-۲۰- بیماریزایی ………………………………… ۷۳
۲-۲۰- علائم کالبد گشایی……………………………. ۷۴
۲۱- سیر همهگیری………………………………… ۷۵
۱-۲۱-مخزن……………………………………… .. ۷۵
۲-۲۱-راه انتقال………………………………… ۷۶
۳-۲۱-جمعیت میزبان………………………………. ۷۷
۲۲-پیشگیری وکنترل ……………………………… ۷۷
۱-۲۲- اقدامات لازم برای محافظت مناطق عاری از بیماری…. ۷۷
۲-۲۲- اقدامات لازم هنگام شیوع بیماری………………. ۷۸
۳-۲۲- اقدامات لازم در مناطق آلوده بومی…………….. ۷۸
۲۳-واکسن…………………………………………. ۷۹
۱-۲۳-واکسن MmmLC ……………………………… 79
۲-۲۳-واکسن Mccp ………………………………… 79
۳-۲۳-واکسن Mcc ………………………………… 79 79-اختصاصیت میزبان در کلاستر مایکوئیدس ……………… ……. ۸۰
۲۵-تشخیص افتراقی……………………………….. ۸۰
۱-۲۵-شناسایی عامل بیماری زا …………………….. .. ۸۱
۱-۱-۲۵-بررسی میکروسکوپیک اگزودای ریه از طریق تهیه اسمیر یا برش بافتی ۸۱
۲-۲۵- تشخیص آزمایشگاهی …………………………. ۸۱
۱-۲-۲۵- روش کشت و جداسازی………………………… ۸۱
۱-۱-۲-۲۵- انتخاب نمونه ها ………………………….. ۸۲
۲-۱-۲-۲۵- آماده سازی نمونه ها ……………………. ۸۲
۳-۲۵- تستهای بیوشیمی……………………………. ۸۳
۴-۲۵- روشهای سرولوژی……………………………. ۸۵
۱-۴-۲۵- عوامل موثر در آزمایشات سرولوژی ……………… ۸۵
۲-۴-۲۵- تست مهاری رشد ……………………………. ۸۷
۳-۴-۲۵- تست ایمونو فلورسانس ……………………….. ۸۸
۴-۴-۲۵- تست رسوب ژلی…………………………….. .. ۸۸
۵-۴-۲۵- تست فیکساسیون کامپلمان …………………….. ۸۹
۶-۴-۲۵- تست ممانعت از هماگلوتیناسیون ……………….. ۸۹
۷-۴-۲۵- تست آگلوتیناسیون لاتکس…………………….. ۹۰
۸-۴-۲۵- تست الیزای رقابتی………………………… ۹۱
۹-۴-۲۵- سایر تستهای تشخیصی……………………….. ۹۴
۵-۲۵ – مشکلات روشهای سنتی………………………… ۹۴
۶-۲۵- تشخیص با استفاده از PCR……………………. 95
فصل دوم: روش کار
۲۶- روش کار …………………………………… ۱۰۱
۱-۲۶- جمع آوری نمونه ……………………………… ۱۰۱
۱-۱-۲۶- مواد لازم………………………………….. ۱۰۱
۲-۱-۲۶- بخش جمع آوری نمونه……………………….. ۱۰۱
۳-۱-۲۶- نمونه برداری ……………………………. ۱۰۳
۲-۲۶- کشت و جداسازی نمونه ها……………………… ۱۰۴
۱-۲-۲۶- مواد لازم ……………………………….. ۱۰۴
۲-۲-۲۶- طرز تهیه محیط کشت اختصاصی برای جداسازی مایکوپلاسمای نشخوار کنندگان ۱۰۶
۱-۲-۲-۲۶- مواد لازم ……………………………… ۱۰۶
۲-۲-۲-۲۶- روش تهیه محیط کشت…………………………. ۱۰۷
۳-۲۶- استخراج DNA مایکوپلاسما…………………….. ۱۰۹
۱-۳-۲۶- روش استخراج DNA از نمونه های ارسالی………….. ۱۰۹
۴-۲۶- فرایند PCR ………………………………. 110
۱-۴-۲۶- مواد لازم ……………………………….. ۱۱۰
۲-۴-۲۶- آماده سازی مواد جهت واکنش PCR ………………. 112
۱-۲-۴-۲۶- افزوده سازی DNA نمونهها ……………….. ۱۱۲
۲-۲-۴-۲۶- افزوده سازی DNA کلونیهای جدا شده………… ۱۱۵
۳-۲-۴-۲۶- تهیه مخلوط اصلی اولیه…………………… ۱۱۵
۳-۴-۲۶- پرایمرها………………………………… ۱۱۵
۴-۲۶- واکنش PCR………………………………… 117
۵-۲۶- تهیه ژل الکتروفورز ……………………….. ۱۱۸
۱-۵-۲۶- طرز تهیه محلول اتیدیوم برماید ………………. ۱۱۹
۶-۲۶- الکتروفورز …………………………………. ۱۲۱
۷-۲۶- رویت باندهای ایجاد شده ……………………. ۱۲۲
فصل سوم: نتایج
۲۷- نتایج …………………………………….. .. ۱۲۴
۱-۲۷- جداسازی………………………………….. ۱۲۴
۱-۱-۲۷- بررسی عملکرد محیط کشت…………………….. ۱۲۴
۲-۱-۲۷- نتایج کشت نمونه های ارسالی ……………….. ۱۲۴
۱-۲-۱-۲۷- نتایج روز پنجم ……………………….. ۱۲۵
۲-۲-۱-۲۷- نتایج روزهفتم تا دهم……………………. ۱۲۵
۳-۲-۱-۲۷- نتایج روزپانزدهم……………………….. ۱۲۶
۲-۲۷- نتایج PCR ………………………………… 126
۱-۲-۲۷- نتایج PCR نمونه ها با پرایمر جنس ………… ۱۲۶
۲-۲-۲۷- تائید کلونی های جدا شده…………………… ۱۲۷
۳-۲-۲۷- نتایج PCR نمونه ها با پرایمر کلاستر مایکوئیدس. ۱۲۷
۴-۲-۲۷- نتایج PCR نمونه ها با پرایمر گونه آگالاکتیه… ۱۲۸
۵-۲-۲۷- نتایج PCR نمونه ها با پرایمر گونه مایکوئیدس کلونی بزرگ ۱۲۹
۳-۲۷- نتایج کالبد گشایی…………………………. ۱۳۰
۱-۳-۲۷- معیار انتخاب ……………………………. ۱۳۰
فصل چهارم: بررسی نتایج
نمودارها…………………………………………. ۱۳۱
فصل پنجم: بحث
۲۸- بحث …………………………………………. ۱۳۹
۱-۲۸- ضایعات کالبد گشایی…………………………… ۱۳۹
۲-۲۸- میزان وقوع عفونت تنفسی مایکوپلاسما ………….. ۱۴۱
۳-۲۸- روش کشت………………………………….. ۱۴۲
۴-۲۸- روش PCR ………………………………… 147
۵-۲۸- فراوانی گونه ها ………………………….. ۱۵۲
۲۹- خلاصه انگلیسی……………………………….. ۱۵۹
۳۰- منابع …………………………………….. .. ۱۶۰
فهرست تصاویر
عنوان …………………………………………………………
تصویر شماره ۱: کلونی تخم مرغی شکل مایکوپلاسما پس از سومین ساب کالچر ۱۲۵
تصویر شماره ۲: آزمایش PCR برای تشخیص جنس مایکوپلاسما در نمونه ریه ۱۲۷
تصویر شماره ۳: آزمایش PCR برای تشخیص کلاستر مایکوئیدس در نمونه ریه ۱۲۸
تصویر شماره ۴: آزمایش PCR برای تشخیص گونه آگالاکتیه درنمونه ریه ……………………………………… ……………………………………… ……………………………………… ……………………………………… ۱۲۹
تصویر شماره ۵: آزمایش PCR برای تشخیص گونه مایکوئیدس مایکوئیدس کلونی بزرگ ۱۳۰
فهرست جداول
عنوان ……………………………………………………………………….
جدول۱: طبقه بندی مایکوپلاسما……………………….. ۱۱
جدول ۲: معرفی اعضا کلاستر مایکوئیدس و خصوصیات بیماریزایی آنها ۱۱
جدول ۳: احتیاجات غذایی برای رشد مایکوپلاسماهای کلاستر مایکوئیدس ۳۹
جدول ۴ : مقادیر موردنیاز جهت تهیه مخلوط اصلی اولیه…. ۱۱۲
جدول ۵: مواد مورد نیاز واکنش تکثیر ………………. ۱۱۴
جدول۶ : پرایمرهای استفاده شده در واکنش تکثیر ……… ۱۱۶
جدول ۷ : برنامه واکنش پرایمرها ………………….. ۱۱۸
جدول۸: : فرمول تهیه محیط TBE(5X)…………………. 120
جدول۹: میزان اتیدیوم بروماید مصرفی جهت ساختن مقادیر متفاوت ژل ۱۲۰
فهرست نمودارها
عنوان ……………………………………………………………………
نمودار شماره ۱: درصد مایکوپلاسمای جدا شده به روش کشت در عفونت تنفسی
گلههای مورد مطالعه……………………………. ۱۳۲
نمودارشماره ۲: درصد حضور مایکوپلاسما درعفونت تنفسی گلههای مورد
مطالعه به روشPCR …………………………….. 132
نمودار شماره۳ : مقایسه روشهای کشت و PCR در تشخیص مایکوپلاسما ی موجود در عفونت تنفسی گلههای مورد مطالعه…………………. ۱۳۳
نمودار شماره۴: مقایسه نتایج کشت وPCR نمونهها در گلههای مورد مطالعه (n=100) ۱۳۳
نمودار شماره ۵: مقایسه نتایج کشت و PCR مایکوپلاسما در گاو (n=50) ۱۳۴
نمودار شماره ۶: مقایسه نتایج کشت و PCR مایکوپلاسما در گله های گوسفند (n=30) 134
نمودار شماره ۷: مقایسه نتایج کشت و PCR در گلههای بز (n=20) ۱۳۵
نمودار شماره۸: نمودار شماره ۸:مقایسه نتایج تشکیل کدورت در محیط براث و PCR مایکوپلاسما در گلههای مورد مطالعه (n=100) ………… 135
نمودار شماره ۹: نمودار شماره۹:مقایسه نتایج ایجاد کدورت در محیط براث و جداسازی مایکوپلاسما در گلههای مورد مطالعه (n=100) …. 136
نمودار شماره ۱۰: نمودار شماره۱۰: مقایسه نتایج تشکیل کدورت در محیط براث و PCR مایکوپلاسما
در گلههای گاو(n=50)……………………………. 136
نمودار شماره ۱۱: نمودار شماره ۱۱:مقایسه نتایج تشکیل کدورت در محیط براث و PCR مایکوپلاسما
در گلههای بز (n=20)……………………………. 137
نمودار شماره۱۲: مقایسه نتایج تشکیل کدورت در محیط براث و PCR مایکوپلاسما در گلههای گوسفند (n=30) …………………………. 137
پروژه بررسی عفونت ریوی مایکوپلاسمایی ناشی از مایکوپلاسما در گوسالهها و بزهای به روش PCR
قیمت : 8000 تومان